Informace o výzkumné skupině

Vedoucí skupiny: doc. RNDr. Jan Bobek, Ph.D. (jan.bobek@lf1.cuni.cz, tel. +420 224 968 592).

Studujeme buněčnou diferenciaci a produkci sekundárních metabolitů u aktinobakterií ze skupiny streptomycet a příbuzných organismů. Tyto bakterie jsou výjimečné komplexním vývojem a slouží jako klíčový zdroj bioaktivních látek s antimikrobiálními, imunomodulačními, kancerostatickými účinky s vysokým potenciálem pro humánní medicínu. Zaměřujeme se na systémovou analýzu genové exprese při vývojových přechodech, zejména na pleiotropní regulace prostřednictvím sigma faktorů a malých regulačních RNA, s cílem vytvářet mutantní kmeny se zvýšenou produkcí antibiotik. Ve spolupráci s Ústavem půdní biologie Biologického Centra AV ČR izolujeme nové kmeny autonomních či s hostitelem-asociovaných streptomycet.
Ve spolupráci s klinickými pracovišti po celé ČR shromažďujeme a charakterizujeme unikátní sbírku streptomycet izolovaných z lidských klinických vzorků, u nichž hodnotíme jejich patogenní a bioaktivní potenciál. Testování nových produkčních kmenů nám umožňuje objevovat nové látky účinné na rezistentní mikroorganismy, látky s protizánětlivým efektem nebo slibné kandidáty pro biotechnologické aplikace a produkci modifikovaných a hybridních metabolitů. Spolupracujeme též na vývoji biodegradačních procesů pro rozklad reziduí makrolidových antibiotik v odpadních vodách a půdě pomocí specializovaných izolátů streptomycet s cílem přispět ke snížení environmentální zátěže a předcházení nárůstu rezistencí patogenních bakterií k makrolidům.

Webové stránky výzkumné skupiny: https://bacterlab.lf1.cuni.cz/